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現(xiàn)在的情況就是，有關藩屬、朝貢的相關事務，分散在朝廷的各個衙門中，對于處理藩屬事務是極為不利的，就以對于藩屬的賞賜為例，就需要主客司與戶部、內(nèi)府等其他機構一起辦理才行。

戶部與內(nèi)府是給賜物品的頒發(fā)機構，主客司是給賜的執(zhí)行機構。在這些機構合作順利的時候尚且無事，一旦大明的這些官僚機構扯起皮來，那就是曠日持久了，這種情況并不是沒有出現(xiàn)過，所以朱載坖認為，要在朝廷專門設立一個部院機構，負責管理這些藩屬事務。

對于朱載坖的意思，禮部表示反對，禮部反對的原因很簡單，就是認為這樣對侵奪禮部的權力，在禮部看來，一旦按照朱載坖的想法，設立專司負責管理藩屬事務，那就等于實際剝奪了禮部管理外交的權力。

但是朱載坖認為并非如此，外交是外交，藩屬是藩屬，兩碼事情，禮部仍舊負責外交事務，但是將藩屬的管理單獨設立一個機構，朱載坖連名字都想好了，就叫理藩院，專門負責對這些藩屬的管理。

就像朝鮮人自己說的，能做大明的狗就是最大的榮幸啊，不像有的狗跑來跑去都不知道他的主人是誰。既然是有主的狗，就得拴上鏈子，要不然萬一被人家給當野狗打了怎么說理去。

朱載坖認為，管理藩屬，事關重大，理藩院的品級也不能太低，與六部都察院一樣為正二品衙門，關鍵的就是理藩院的執(zhí)掌問題，主要是理藩院和禮部的職權區(qū)分問題。

朱載坖召集閣部重臣商量此事，禮部尚書趙貞吉對此是有些不滿的，雖然朱載坖已經(jīng)下達決心要設立理藩院了，但是趙貞吉還是認為可以爭取一下，將理藩院變成禮部的一個下屬機構，趙貞吉認為，理藩院所執(zhí)掌的，本來就是之前禮部主客司的部分職能，即便是成立了理藩院，理藩院的很多事務也是和禮部分不開的。

這點倒是獲得了朱載坖的部分贊同，理藩院和禮部確實是有密不可分的關系，但是朱載坖和趙貞吉的想法并不一樣，朱載坖的意思是逐漸將禮部的外交職能向理藩院轉(zhuǎn)移，最終將理藩院變成專門的外事衙門，所以朱載坖說道：“大宗伯的話確實是有些道理，理藩院和禮部，在很多事務上是有重合之處，兩個衙門很多時候是要協(xié)同辦公的，但是事涉藩屬，還是要重其體例以示朝廷之重視?！?

朱載坖認為，理藩院的長官以禮部尚書銜掌院事，同時和其他六部一樣，下設兩位侍郎協(xié)助掌院處理政務，其下是各司，負責處理具體政務，這才是重點，涉及到理藩院的具體執(zhí)掌。

首先就是從其他衙門劃轉(zhuǎn)理藩院的部門，原屬禮部的會同館、還有主客司的部分人員、鴻臚寺等都要轉(zhuǎn)隸理藩院，除此之外，就是理藩院本衙下設的各司，經(jīng)過朱載坖和重臣們商量，理藩院下設稽勛司、賓客司、柔遠司、理刑司，稽勛司負責頒授印信，管理這些藩屬的王位、服色等。

賓客司負責接待藩屬的使者的，柔遠司負責制定對這些藩屬的賞賜，理刑司負責處理這些藩屬對大明不恭順或者說背叛大明等行為。