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除了筑城之外，還有就是加強浙江的兵防了。

之前嘉靖準(zhǔn)允戚繼光在浙江招募營兵，用于御倭，但是等到戚繼光把兵練出來，恐怕還需要時日，胡宗憲在戚繼光練成新軍之前還要另想辦法，加強浙江的防備。

在和鄭若曾、徐渭等人商量后，胡宗憲決定向朝廷請求設(shè)置杭嚴(yán)兵備一員；金衢兵備一員；嘉湖兵備一員； 臺州兵備一員；溫處兵備一員，五名兵備將浙江劃分為五個地域，統(tǒng)籌防御。

同時，在浙江總兵下設(shè)分守杭嘉湖參將， 分守溫處參將，分守寧紹參將，分守臺金嚴(yán)參將四名分守參將，在總兵兵備的指揮下坐鎮(zhèn)一方，好讓戚繼光專心練兵。

同時，對于浙江的衛(wèi)所和各處水寨，也要加以整頓，朝廷本來在浙江設(shè)立了在浙江地區(qū)共設(shè)十六衛(wèi)、 三十四守御千戶所，其中海寧衛(wèi)、海門衛(wèi)、觀海衛(wèi)、盤石衛(wèi)、金鄉(xiāng)衛(wèi)、松門衛(wèi)、臨山衛(wèi)、昌國衛(wèi)、 定海衛(wèi)作為沿海衛(wèi)所，有專司備倭的職責(zé)。

要是按朝廷的名冊上，浙江的衛(wèi)所官家數(shù)量可不算上，按軍籍上的數(shù)字，浙江一省各衛(wèi)有兵五萬八千七百五十余人，水師力量更是不小，瀕海九衛(wèi)戰(zhàn)船六百六十艘，可實際上有多少，那就只有天知道了。

指望浙江的衛(wèi)所官軍估計是不太現(xiàn)實的，胡宗憲等人把希望寄托在巡檢司的弓兵身上。巡檢司的弓兵并非正規(guī)軍，而是地方民兵，由州縣直接掌握。

來源主要有三：其一為均徭簽派，即所謂弓兵者每縣括民丁役之，統(tǒng)于巡檢，這是弓兵來源最廣泛的途徑；其二為募民充役，此種情況多出現(xiàn)于倭寇比較猖獗后朝廷加強地方的防御能力； 其三永充弓兵，此種途徑所占比例最小，永充的形式有兩種，一種是在明初僉編的世籍弓兵，一種是因犯罪而被謫發(fā)充軍。

巡檢司有沿海和內(nèi)地兩種，沿海巡檢司的設(shè)置主要在于備倭。浙江沿海巡檢司有五十余處，分布于備倭要地。沿海巡檢司雖屬州縣管轄，但是在軍事上受衛(wèi)所的節(jié)制。裝備也比地方的弓兵要好一些，這些巡檢司的弓兵由于常年與倭寇作戰(zhàn)，戰(zhàn)斗力還算不錯。

就是布置的太過于分散了，每個巡檢司只有八十到一百人，胡宗憲決定增加巡檢司的兵額，以一百八十到兩百人為基準(zhǔn)，招募民間的驍勇，包圍鄉(xiāng)土。

本來浙江都指揮使司下有專門的浙江總督備倭都司，負(fù)責(zé)全省的備倭事宜，但是由于現(xiàn)在衛(wèi)所廢弛，根本起不到什么作用。

胡宗憲還是決定上奏朝廷，要求恢復(fù)大明之前的巡海制度。在太祖時期，倭寇也是頻頻作亂，襲擾大明沿海，明太祖震怒，親自誓師，向海神祈禱后派遣明軍水師巡海殲滅倭寇，太祖皇帝當(dāng)時的祝詞是：予受命上穹，為中國主，惟圖 乂民，罔敢怠逸。蠢彼倭夷，屢肆寇劫，濱?？たh多被其殃。今命將統(tǒng)帥舟師揚帆海島，乘機征剿，以靖邊氓。特備牲醴，用告神知。

洪武七年春正月，廣洋、江陰、橫海、水軍四衛(wèi)正式開始出海巡倭：“詔以靖海侯吳禎為總兵官，都督僉事于顯為副總兵官，領(lǐng)江陰、廣洋、橫海、水軍四衛(wèi)舟師出海巡捕?？?，所統(tǒng)在京各衛(wèi)及太倉、杭州、溫、臺、明、福、漳、泉、潮 州沿海諸衛(wèi)官軍悉聽節(jié)制。

這次巡海，成為以后明軍巡海的定例，每春以舟師出海，分路防倭，迄秋乃還。但是后來衛(wèi)所水師廢弛，戰(zhàn)船殘破，根本無力組織起大規(guī)模的海上行動，這種巡海備倭也就逐漸停止了。